Regionalna Dyrekcja Ochrony Środowiska w Warszawie realizuje projekty z zakresu ochrony przyrody oraz ochrony obszarów Natura 2000. Są to m.in. wnioski dotyczące ochrony zagrożonych wyginięciem populacji roślin i zwierząt chronionych z mocy prawa krajowego oraz międzynarodowego, jak również wnioski dotyczące prac nad planami zadań ochronnych dla obszarów Natura 2000. Dofinansowanie tych zadań pochodzi z:

• Programu Operacyjnego Infrastruktura i Środowisko,
• Programu Operacyjnego Pomoc Techniczna,
• Narodowego Funduszu Ochrony Środowiska i Gospodarki Wodnej,
• Wojewódzkiego Funduszu Ochrony Środowiska i Gospodarki Wodnej w Warszawie.